Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK16Q00536 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms