Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX1P83916 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX1P83916 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX1P83916 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX1P83916 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX1P83916 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX1P83916 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBX1P83916 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms