Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HTRA4P83105 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms