Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIM1P81133 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIM1P81133 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIM1P81133 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIM1P81133 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIM1P81133 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIM1P81133 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms