Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
RPS29P62273 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RPS29P62273 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
RPS29P62273 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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