Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZEB1P37275 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms