Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms