Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OTX2P32243 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OTX2P32243 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms