Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTSSP25774 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CTSSP25774 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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