Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP2A2P16615 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms