Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETFAP13804 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFAP13804 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFAP13804 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms