Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F5P12259 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F5P12259 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F5P12259 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms