Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPIND1P05546 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms