Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EDN1P05305 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDN1P05305 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDN1P05305 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms