Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KRT6BP04259 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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KRT6BP04259 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KRT6BP04259 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KRT6BP04259 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KRT6BP04259 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KRT6BP04259 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KRT6BP04259 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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