Protein–RNA interactions for Protein: P02538

KRT6A, Keratin, type II cytoskeletal 6A, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6AP02538 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6AP02538 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms