Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHEP01854 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHEP01854 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms