Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1QL1O75973 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1QL1O75973 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C1QL1O75973 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms