Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SIN3BO75182 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SIN3BO75182 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms