Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms