Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBAG9O00559 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms