Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCER2I3L3R5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms