Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP5A6NIR3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms