Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms