Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TARSL2A2RTX5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms