Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms