Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPACA6W5XKT8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPACA6W5XKT8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPACA6W5XKT8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPACA6W5XKT8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPACA6W5XKT8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPACA6W5XKT8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPACA6W5XKT8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPACA6W5XKT8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms