Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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