Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms