Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms