Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTPS2Q9NRF8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms