Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHST12Q9NRB3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms