Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms