Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms