Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSDMCQ9BYG8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms