Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KATNB1Q9BVA0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms