Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMM29Q9BSF4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms