Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BICD1Q96G01 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BICD1Q96G01 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms