Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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