Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCG3Q8WXD2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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