Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LNX2Q8N448 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LNX2Q8N448 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LNX2Q8N448 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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