Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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