Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDCCQ504Y2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms