Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY8

ARL13B, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL13BQ3SXY8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL13BQ3SXY8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL13BQ3SXY8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms