Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms