Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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