Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB39AQ14964 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms