Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PEX6Q13608 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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