Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCGQ13326 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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