Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms